В 1990 году в г. Калининграде была создана экспертная группа Центральной Ленинградской лаборатории судебной экспертизы, которая позже была преобразована в Калининградский отдел Северо-Западного регионального центра судебной экспертизы.

   Приказом от 10.02.1999 № 32 «О преобразовании Калининградского и Калужского отделов в самостоятельные лаборатории судебной экспертизы» Калининградский отдел Северо-Западного регионального центра судебной экспертизы преобразован в Калининградскую лабораторию судебной экспертизы.

   У самых истоков стояли и продолжают работать по настоящее время эксперты  Фадин Николай Сергеевич, Гнатюк Наталья Викторовна, Саркисова Татьяна Авестисовна, Борячок Лариса Николаевна, Ширина Надежда Алексеевна, Кудрявцева Нина Александровна, Фумин Игорь Николаевич, Муртазина Виолетта Гинтауто.

  В настоящее время в штате Лаборатории 25 экспертов, аттестованных на право самостоятельного производства экспертиз по 22 экспертным специальностям, из них 10 экспертов одновременно владеют несколькими экспертными специальностями.

  Высокая квалификация экспертов Лаборатории подтверждается, в первую очередь, достигнутыми результатами. Из года в год Лаборатория выполняет и перевыполняет установленное Государственное задание.

  Лаборатория является единственным государственным судебно-экспертным учреждением Калининградской области, в котором проводится широкий спектр экспертиз и экспертных исследований.

  Свой юбилей Лаборатория встречает в процессе обновления - в данный момент проводится реставрация фасада и капитальный ремонт здания учреждения, закупается новое оборудование, ряды экспертов пополняются молодыми специалистами. Всё это вселяет уверенность в дальнейшем расширении и процветании ФБУ Калининградской ЛСЭ Минюста России.